現在は復旧したけども、設置しているMediawikiのコンテンツが表示されなくなっていた。ただDBは生きていたので、一部のphpファイルが破損したのかもしれない？まあ原因は不明だし調べる気力もないが。復旧方法は、アップグレードしただけ。直ったのでよかった。